一、区委机构
（一）区委工作部门
中共重庆市巴南区纪律检查委员会（重庆市巴南区监察局）
中共重庆市巴南区委办公室〔中共重庆市巴南区委保密委员会办公室（重庆市巴南区国家保密局）、中共重庆市巴南区委机要局〕
中共重庆市巴南区委组织部(中共重庆市巴南区委党代表联络办公室）
中共重庆市巴南区委宣传部〔中共重庆市巴南区委对外宣传办公室（重庆市巴南区人民政府新闻办公室）〕
中共重庆市巴南区委统一战线工作部〔中共重庆市巴南区委台湾工作办公室（重庆市巴南区人民政府台湾事务办公室）〕
中共重庆市巴南区委政法委员会（重庆市巴南区社会治安综合治理委员会办公室）
重庆市巴南区机构编制委员会办公室
中共重庆市巴南区直属机关工作委员会
（二）区委部门管理机构
中共重庆市巴南区委研究室
中共重庆市巴南区委老干部局
（三）区委直属事业单位
中共重庆市巴南区委党校（重庆市巴南区行政学校）
中共重庆市巴南区委党史研究室
二、区人大常委会综合办事机构和工作委员会
重庆市巴南区人大常委会办公室
重庆市巴南区人大常委会财经城环工作委员会
重庆市巴南区人大常委会法制工作委员会
重庆市巴南区人大常委会教科文卫工作委员会
重庆市巴南区人大常委会农业与农村工作委员会
重庆市巴南区人大常委会人事代表工作委员会
三、区政府机构
（一）区政府工作部门
重庆市巴南区人民政府办公室（重庆市巴南区人民政府法制办公室、重庆市巴南区人民政府外事办公室）
重庆市巴南区改革和发展委员会（重庆市巴南区经济体制改革办公室）
重庆市巴南区经济委员会（重庆市巴南区招商引资办公室、重庆市巴南区中小企业发展指导局、重庆市巴南区乡镇企业局）
重庆市巴南区教育委员会
重庆市巴南区科学技术委员会
重庆市巴南区人民政府民族宗教侨务办公室
重庆市巴南区监察局（中共重庆市巴南区纪律检查委员会）
重庆市巴南区民政局
重庆市巴南区司法局
重庆市巴南区财政局
重庆市巴南区人事局
重庆市巴南区劳动和社会保障局
重庆市巴南区建设委员会
重庆市巴南区交通局
重庆市巴南区水利农机局
重庆市巴南区农牧渔业局（重庆市巴南区人民政府农业办公室、重庆市巴南区农业综合开发办公室）
重庆市巴南区商业委员会（重庆市巴南区对外贸易经济委员会）
重庆市巴南区文化广电新闻出版局
重庆市巴南区卫生局（重庆市巴南区爱国卫生运动委员会办公室、重庆市巴南区红十字会）
重庆市巴南区人口和计划生育委员会
重庆市巴南区审计局
重庆市巴南区移民局
重庆市巴南区环境保护局
重庆市巴南区统计局
重庆市巴南区林业局
重庆市巴南区旅游局
重庆市巴南区粮食局
重庆市巴南区安全生产监督管理局
重庆市巴南区市政园林管理委员会
（二）区政府部门管理机构
中共重庆市巴南区委、重庆市巴南区人民政府信访办公室
重庆市巴南区物价局
（三）议事协调机构的办事机构
重庆市巴南区国防动员委员会人民防空办公室
（四）区政府直属事业单位
重庆市巴南区区级机关事务管理局
重庆市巴南区体育局
重庆市巴南区地震局
重庆市巴南区房地产管理局
重庆市巴南区档案馆（重庆市巴南区档案局）
重庆市巴南区地方志办公室
重庆市巴南区招生自学考试办公室
重庆市巴南区老龄工作委员会办公室
重庆市巴南区行政审批服务中心管理办公室
重庆市巴南区经济开发管理办公室
重庆市巴南区供销合作社联合社
四、区委、区政府派出机构
重庆市巴南区经济园区开发建设管理委员会
重庆市巴南区龙洲湾新区管理委员会
五、区政协综合办事机构和专门委员会办事机构
政协重庆市巴南区委员会办公室
政协重庆市巴南区委员会研究室
政协重庆市巴南区委员会委组工作办公室
政协重庆市巴南区委员会提案工作办公室
六、重庆市巴南区人民法院
七、重庆市巴南区人民检察院
八、民主党派
中国国民党革命委员会重庆市巴南区委员会
中国民主同盟重庆市巴南区委员会
中国民主建国会重庆市巴南区委员会
中国农工民主党重庆市巴南区委员会
中国民主促进会重庆市巴南区委员会
九、社会团体、群众团体
重庆市巴南区工商业联合会（重庆市巴南区总商会）
重庆市巴南区总工会
共青团重庆市巴南区委员会
重庆市巴南区妇女联合会
重庆市巴南区科学技术协会
重庆市巴南区文学艺术界联合会
重庆市巴南区归侨侨眷联合会
重庆市巴南区残疾人联合会